La polymyxine B dans l’environnement : une étude de protéomique, de transcriptomique et phénotypique sur Vibrio cholerae

Les peptides antimicrobiens, dont la polymyxine B, sont des molécules utilisées en médecine vétérinaire et dans le traitement d'infections résistantes aux antibiotiques chez l'homme. Puisque les polymyxines sont très peu absorbées, une grande proportion de ce qui est utilisé est excrétée par les urines dans l'eau et s'y accumule. Elles s'y retrouvent donc en concentrations qui ne sont pas efficaces pour tuer les bactéries, mais qui peuvent moduler des facteurs de virulence, de résistance et de persistance. Vibrio cholerae, la bactérie responsable du choléra, est retrouvée dans l'eau. Nous avons effectué une analyse de ses protéines en présence de concentrations sous-inhibitrices de polymyxine B et avons trouvé que celle-ci module plus de 61% des protéines sécrétées par la bactérie, dont Hcp, une protéine du système de sécrétion de type VI (T6SS). Le T6SS permet à V. cholerae d'entrer en compétition avec les autres bactéries, de survivre aux prédateurs et est un facteur de virulence. Nos résultats montrent que l'augmentation de la sécrétion par le T6SS en présence de concentrations sous-inhibitrices de polymyxine B améliore la capacité de V. cholerae à entrer en compétition avec les autres bactéries et de survivre aux prédateurs. Une analyse transcriptomique a ensuite permis de découvrir un régulateur responsable de l'augmentation de la production de Hcp en présence de polymyxine.