Caractérisation de la spécificité d’infection des phages de Clostridioides difficile

Clostridioides difficile (CD) est la cause principale de diarrhée post-antibiotique dans les pays industrialisés. Les traitements standards utilisés pour traiter la bactérie s’avèrent inefficaces pour empêcher les récidives. C’est pourquoi d’autres alternatives thérapeutiques sont envisagées, comme la phagothérapie, qui consiste à utiliser les bactériophages (phages), i.e. des virus ciblant spécifiquement les bactéries. L’objectif de cette étude est de caractériser la spécificité d’interaction des phages envers leur bactérie hôte. CD possède à sa surface une enveloppe protéique, la « couche S », majoritairement composée de la protéine SlpA. Une souche mutante n’exprimant pas SlpA à sa surface a été isolée, et s’est avérée être résistante à tous les phages capables d’infecter la souche sauvage normalement. Des tests de complémentation et d’infection de la souche mutante exprimant différentes isoformes de SlpA ont montré que les phages sont capables de reconnaître spécifiquement une ou plusieurs isoformes de la protéine afin d’infecter la bactérie. De plus, une partie du domaine variable de faible poids moléculaire de SlpA semble être déterminante pour l’adsorption et l’infection par certains phages. Nos travaux permettront éventuellement l’élaboration de cocktails de phages thérapeutiques ciblant différentes isoformes de SlpA et permettant de couvrir l’ensemble des souches de CD responsables d’infections.