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Les systèmes de santé apprenants permettent la réutilisation des données cliniques à des fins de recherche et d’aide à la décision.  Ils reposent sur un accès large aux données cliniques, qui sont généralement dispersées dans de nombreux systèmes d'information hétérogènes. Les ontologies appliquées permettent de proposer une représentation commune de ces données, rendant possible leur interopérabilité indépendamment des architectures des systèmes sources. Nous développons ce modèle ontologique au sein de la plateforme de santé apprenante PARS3, et nous avons déjà créé plusieurs o…

Les cadres éthiques au Québec n’ont pas été établis en tenant compte des systèmes de santé apprenants (SSA), ce qui signifie que les modèles de consentement actuels pour l’utilisation secondaire des données de santé ne sont pas adéquats. L’implantation imminente d’un SSA au Québec amène l’urgence de revoir le cadre éthique pour qu’il s’arrime à une cette transition des systèmes de santé. Le projet CLARET a donc été mis en place afin de proposer des méthodes alternatives de consentement qui sont plus appropriées en contexte de SSA. Plus concrètement, au cours des années 2017 à 2019, l’équip…

Le CISSS Chaudière Appalaches implante, avec l’INESSS, un projet CoMPAS+ ciblant la qualité des transitions des soins des aînés avec démence. Ce projet implantera un atelier de pratique réflexive pour l’analyse du portrait de l’état de santé et de l’utilisation des services en regard des bonnes pratiques en démence, permettant d’engager des réflexions autour du rôle des intervenants et le développement d’une lecture commune des pratiques sur le territoire. La rétroaction basée sur les indicateurs permettra d’identifier des cibles d’amélioration et des actions pour améliorer le continuum de…

L’informatisation massive des données médicales ouvre de nouvelles possibilités d’amélioration des soins et de recherche biomédicale. Par exemple, la conception d’études prospectives et rétrospectives de grande échelle et le développement d’outils sophistiqués d’aide à la décision pour les professionnelles et professionnels de la santé. Cependant, l’implantation d’une telle plateforme se heurte à de multiples problématiques, comme l’hétérogénéité naturelle des données médicales. Les données sont difficilement interopérables puisqu’elles sont générées par des processus uniques à chaque étab…

Le don de plasma, tout comme le don de sang, est soumis à différentes restrictions. Ces critères visent à assurer la sécurité des produits sanguins pour le receveur. Puisque l’incidence et la prévalence du VIH sont plus élevées chez les hommes ayant des relations sexuelles avec d’autres hommes (HARSAH), ces derniers sont proscrits du don, au Canada, pour une période de trois mois suivant leur dernière relation HARSAH. Héma-Québec travaille à assouplir ce critère, de manière sécuritaire, puisqu’il peut être considéré comme discriminatoire. On vise, dans un premier temps, le plasma récolté p…

La leucémie lymphoblastique aiguë (LLA) constitue près du tiers des cas de cancers pédiatriques enregistrés chaque année au Canada. Bien que les traitements actuels permettent d’atteindre un taux de survie de 5 ans de 90%, nous observons que plus de 65% des survivants développent des effets indésirables à long terme dont la dyslipidémie, l’hypertension et l’ostéoporose. Ces effets contribuent à la dégradation de l’état de santé de ces patients et peuvent même constituer un danger pour leurs vies. Notre projet consiste à mettre en place un modèle mathématique permettant la prédiction de ces…

Le risque est une entité omniprésente dans le domaine biomédical. Les références à des risques sont donc fréquentes dans les données médicales. Une caractérisation ontologique cohérente du risque s'avère alors nécessaire. En effet, des outils informatiques, les ontologies appliquées, permettent de structurer les données afin d'en faciliter l'échange entre différents systèmes d'information de les utiliser à des fins cliniques. Le risque est toutefois une entité dont le statut est paradoxal. En effet, il a à la fois un caractère objectif et subjectif : objectif car un risque existe indépenda…

Objectif de la recherche: Développer un outils interprétable pour la classifications automatique des lésions rénales à partir d’ images IRM. La calssification est effectuée selon la nature, maligne ou bénigne des tumeurs et selon leur sous-type et leur grade pour les tumeurs malignes. Problématique: Les réseaux de type ResNet 2D sont connu pour obtenir de bons résultats dans ce type de classification. L’extension d’un réseau de neurone de type ResNet 2D à un réseau de type ResNet 3D peut-elle améliorer la précision des classifications. Méthodologie: Un modèle de ResNet 3D a é…

Prédire efficacement la structure secondaire commune de séquences d’ARN homologues est cruciale pour comprendre les fonctions des ARN non codants, leur influence sur la santé humaine. Dans les dernières années, de nombreuses méthodes ont été développées pour prédire la structure secondaire de familles d’ARN. Il existe trois types d’approches. L’approche 1) « aligner-et-replier » consiste à calculer simultanément l’alignement et le repliement des ARN. L’approche 2) comporte les méthodes de type « aligner-puis-replier » ou « replier-puis-aligner » qui calculent l’alignement et le repliement …

L'analyse distribuée réfère à l'interrogation statistique de données pouvant se trouver à différents endroits physiques, requérant ainsi des processus de calculs et d'analyse indépendants. Cette classe de méthode est de plus en plus demandée, notamment en sciences biomédicales au Canada, où les dossiers de santé sont collectés dans les hôpitaux partagés au niveau provincial, mais où il est souvent difficile de rassembler ce type de données à l'échelle fédéral en une banque placée en un seul lieu physique, en raison de considérations éthiques liées à la confidentialité des données des patie…