85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Nahouo Soro
Colloque : 205 - Nature et interactions de la matière
Les changements climatiques observés depuis quelques années à l’origine de diverses perturbations de notre planète nous interpellent tous.Dans la construction, le matériau terre utilisé depuis des millénaires puis abandonné par la suite apparait comme une alternative pour la réduction des gaz polluants.La technique de construction visée est celle du pisé coulé .Le pisé est un béton de terre et traité avec les méthodes et pratiques usuelles du béton conventionnel.Une première phase concerne la caractérisation du sol étudié faite par des essais variés de laboratoire. Les gros granulats util…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Amel Kaouche
Colloque : 205 - Nature et interactions de la matière
Certains graphes peuvent servir à énumérer les molécules chimiques et leurs isomères. Par exemple, les isomères d’alcanes sont représentés par des arbres dont les sommets internes (les atomes de carbone) sont de degrés 4. Deux défis majeurs se posent dans l’analyse combinatoire de ces molécules, à savoir : 1- tenir compte de leurs contraintes bidimensionnelles ou spatiales, 2- identifier leurs symétrie réflexives et rotationnelles.
Dans ce travail, je donne des nouvelles formules tenant compte des contraintes géométriques des molécules et de leurs symétries internes.
85e Congrès de l'Acfas — Communication par affiche
Auteur : Vincent Ouellette
Colloque : 205 - Nature et interactions de la matière
Le design de ligands symétriques C2 (ligands bivalents/dimères) comme agents thérapeutiques attire l’attention des chercheurs. En effet, ces dimères présentent généralement des propriétés biologiques supérieures aux monomères correspondants. Au niveau moléculaire, l’étude des interactions de ce type de composés avec des macromolécules biologiques (ADN, ARN, récepteur spécifique, etc.) présente un intérêt fondamental majeur et mène à une meilleure compréhension à la fois des sondes et des macromolécules étudiées. Notre laboratoire s’intéresse aux dimères de stéroïdes, pa…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Marc-André Albert
Colloque : 205 - Nature et interactions de la matière
Les corrélations électroniques, ces interactions entre les électrons dans la matière, régissent tout processus chimique. Actuellement, les impulsions lasers attosecondes, d’une brièveté extraordinaire, sont les seuls outils capables de nous offrir la possibilité de sonder et de contrôler les corrélations ultrarapides des électrons au sein de la matière.
Nos travaux de recherche en physique computationnelle et photonique consistent à développer des outils numériques permettant de décrire les corrélations électroniques dans les systèmes atomiques, et de comprendre leur rôle dans le…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Salima Hennani
Colloque : 205 - Nature et interactions de la matière
Nous présentons une étude sur les processus d’excitation et d’ionisation des molécules à plusieurs électrons à l’aide d’une impulsion laser intenses et brèves. Notre algorithme numérique est basé sur la résolution de l’équation de Schrödinger dépendante du temps décrivant le mouvement des électrons en présence du champ laser, en utilisant le calcul quanto-chimique au niveau multi-configurationel avec partition de Feshback de l'espace d'états à N électrons. Nous montrons aussi comment contrôler le processus de transfert de la population entre les états excités vers les canaux d’ionisati…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Chloé Laubu
Colloque : 206 - Organismes vivants
Chez les espèces à soins biparentaux, les partenaires homogames pour leur type comportemental ont un meilleur succès reproducteur que des partenaires dissimilaires. Ceci pourrait s’expliquer par une meilleure coordination entre des partenaires similaires. Il existe deux façons pour être homogames: les partenaires peuvent se choisir initialement sur ce critère ou ils peuvent le devenir en convergeant. Il est crucial de distinguer le mécanisme en jeu car seul le premier implique un rôle de la sélection sexuelle sur l’évolution des types comportementaux. Nous avons étudié cette question chez …
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Ziad W. El-Hajj
Colloque : 206 - Organismes vivants
La réplication de l’ADN est un processus rigoureusement contrôlé dans tous les organismes. Le génome des eucaryotes, que ce soit chez la levure ou chez l’humain, possède plusieurs centaines origines de réplication, chacune composée d’une séquence nucléotidique unique. Les origines de réplication sont initiées de façon systématique commençant par l’origine la plus près du centromère en se dirigeant vers les télomères. Ceci suggère que la position des origines de réplication régule le démarrage de la réplication. Une autre hypothèse suggère que la séquence même de l’origine détermine le temp…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Felix Laroche-Johnston
Colloque : 206 - Organismes vivants
Les introns de groupe II sont des ribozymes présents dans tous les domaines de la vie : chez les bactéries, les archéobactéries, et les organelles de certains eucaryotes. Chez les bactéries, ils sont très autonomes, codant pour une protéine qui assiste l’intron à s’épisser de manière auto-catalytique de l’ARNm sous forme de lariat. L’intron relâché peut ensuite envahir un nouveau site génomique de manière très spécifique grâce à l’activité réverse-transcriptase de la protéine. Les théories évolutives estiment que les introns de groupe II sont à l’origine de plus de 50% du génome humain. To…
85e Congrès de l'Acfas — Communication par affiche
Auteur : Annabelle St-Pierre
Colloque : 206 - Organismes vivants
Actuellement au Québec, les industries forestières se trouvent en situation précaire et tentent, par différent moyen, d’offrir une valeur ajoutée à leur biomasse. L’une des solutions mises de l’avant est l’intégration des extractibles des résidus d’écorces dans la formulation de produits d’assainissement. Ainsi, ce projet vise le développement d’un procédé permettant d’extraire les composés ayant un pouvoir antimicrobien des résidus d’écorces afin de remplacer l’ammonium quaternaire (CAQ), le composé antimicrobien intégré présentement à la formulation des produits de nettoyage ciblés. En e…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Virginie Lemieux-Labonté
Colloque : 206 - Organismes vivants
Depuis 2006, plus de 6 millions de chauves-souris ont été décimées par le syndrome du museau blanc (SMB) en Amérique du Nord. Les mécanismes de cette maladie de la peau causée par le champignon Pseudogymnoascus destructans (Pd) ne sont pas parfaitement compris à ce jour. Des assemblages de taxons distincts au sein du microbiome, c’est-à-dire la communauté de microorganismes vivant en association avec un organisme hôte, pourraient expliquer les différences de résistance entre populations de chauves-souris. Dans ce contexte, cette étude est la première à explorer le microbi…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Emre Yurdusev
Colloque : 206 - Organismes vivants
Les aptamères sont des acides nucléiques capables de lier spécifiquement un ligand donné, tel que des petites molécules, des protéines ou même des bactéries, à titre d’exemples. La sélection d’aptamère se fait via la méthode SELEX qui consiste à faire de l’évolution accélérée in-vitro. Bien que cette approche permette théoriquement de sélectionner des aptamères ayant une grande affinité et sélectivité pour le ligand choisi, les conditions de la sélection (tampon, température, séquences constantes…) peuvent parfois causer une dépendance non-désirée de l’aptamère à ces conditions et…
85e Congrès de l'Acfas — Communication par affiche
Auteur : Katia Smail
Colloque : 206 - Organismes vivants
Nous utilisons des approches bio-informatiques pour trouver des ARN noncodants (ARNnc) et des approches expérimentales pour les confirmer et les caractériser. L’utilisation d’outils bio-informatiques nous fournit des indices sur la fonction des nouveaux motifs grâce à leur contexte génétique ainsi qu’à leurs modèles structuraux. Les nouveaux ARNnc trouvés seront ensuite testés au laboratoire. Pour optimiser les recherches, nous nous focalisons sur les gènes ayant des fonctions connexes, car ils sont beaucoup plus susceptibles d'être contrôlés par les mêmes éléments régulateurs. Pour y parv…
85e Congrès de l'Acfas — Communication par affiche
Auteur : Felix Laroche-Johnston
Colloque : 206 - Organismes vivants
Les introns du groupe II sont des ARN catalytiques et des rétroéléments mobiles présents dans certaines organelles eucaryotes, de plus que dans les bactéries et archées. Ces ribozymes s'auto-épissent à partir du pré-ARNm de gènes interrompus et peuvent se réinsèrent dans des séquences d'ADN cibles. Les hypothèses évolutives placent ces éléments retromobiles à l'origine de plus de la moitié du génome humain. Néanmoins, l'évolution et la dissémination des introns du groupe II s'est révélée très difficile à étudier.
Ici, nous avons caractérisé la relation fonctionnelle et évolutive …
85e Congrès de l'Acfas — Communication par affiche
Auteur : Aurélie Devinck
Colloque : 206 - Organismes vivants
Étude d'ARN noncodant régulant des gènes impliqués dans la synthèse d’un nucléotide avec modifications multiples.
Aurélie Devinck, Katia Smail, Mohammad Reza Naghdi, Jonathan Perreault1
1: INRS-Institut Armand-Frappier, Laval, Quebec
Nous avons utilisé différentes approches bioinformatiques afin de trouver des ARN noncodants. Cette étape nous a permis de sélectionner différents candidats qui seront par la suite testés expérimentalement. Pour la recherche bioinformatique nous nous sommes plus particulièrement focalisé sur des gènes…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Camille Lacarriere
Colloque : 206 - Organismes vivants
La symbiose entre la flore microbienne et l’épithélium, est indispensable au maintien de l’homéostasie intestinale. La dérégulation des voies de signalisation participant à cette interaction peut causer des pathologies inflammatoires chroniques telle la maladie de Crohn (Maloy K.J and Powrie F., 2010). Plusieurs gènes de susceptibilité à la maladie de Crohn identifiés, chez l’Homme, sont impliqués dans l’autophagie (Franke et al., 2010). En effet, ce processus est d’une part nécessaire au maintien de l’homéostasie cellulaire en apportant des nutriments et d’autre part, impliqué da…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Boris Domenech
Colloque : 206 - Organismes vivants
La dispersion océanique longue distance et la dispersion terrestre sont deux hypothèses évoquées en biogéographie historique pour expliquer la répartition des espèces sur la Terre au cours du temps. Nous avons vérifié ces hypothèses par l’étude de l’évolution des arbres tropicaux du genre Crudia, inclus dans la famille des Légumineuses et localisés en Afrique de l’Ouest, en Amérique du Sud et en Asie du Sud-est. Afin de reconstruire l’histoire biogéographique des 55 espèces du genre Crudia, une phylogénie moléculaire a été reconstruite. Le genre Crudia forme un g…
85e Congrès de l'Acfas — Communication par affiche
Auteur : Nicolas Dufour
Colloque : 206 - Organismes vivants
La microalgue Chlamydomonas reinhardtii est depuis longtemps employée à titre d’organisme modèle en ingénierie génétique. Cependant, l’obtention de hauts niveaux d’expression à partir du génome nucléaire reste problématique pour différentes raisons. De plus, l’identification des transformants positifs de C. reinhardtii, exprimant de fortes quantités de protéines recombinantes, est entravée par de laborieux et coûteux processus de criblage. Le projet de recherche propose d’augmenter l’expression transgénique nucléaire en optimisant un vecteur d’expression à partir des pl…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Emilie Boutet
Colloque : 206 - Organismes vivants
Methylobacterium extorquens est une bactérie en mesure de métaboliser le méthanol, une matière première bon marché qui peut être dérivé de déchets. Cette bactérie est donc un organisme modèle pour l’étude du métabolisme des composés à un carbone. Malgré les intérêts grandissants d’utiliser cette bactérie comme un outil biotechnologie pour la production basé sur le méthanol, les ARN noncodants de ce méthanotrophe sont peu connus. Les petits ARN (sARN) jouent un rôle important dans la régulation des gènes, spécialement chez les protéobactéries comme Escherichia coli, ce qui…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Mohammad Reza Naghdi
Colloque : 206 - Organismes vivants
L’importance des ARN noncodants (ARNnc) dans la régulation des gènes nous a motivé à développer des outils bioinformatiques afin de poursuivre la découverte de novo d’ARNnc. Trouver de nouveaux ARNnc est problématique car cela requiert de trouver des structures conservées à travers les immenses banques de séquences publiques. Premièrement, il est difficile de trouver et d’extraire de nombreuses séquences intergéniques pour des gènes ayant une activité particulière à partir de bases de données génomiques. Deuxièmement, le temps de calcul pour la prédiction de structure secondaire d’ARNnc au…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Julie Augustin
Colloque : 206 - Organismes vivants
Anaphes listronoti, une guêpe parasitoïde des œufs, est actuellement l’ennemi naturel le plus efficace contre le charançon de la carotte (Listronotus oregonensis). Les changements climatiques pourraient cependant altérer le contrôle qu’elle exerce sur les populations de ce dernier, de par l’effet de la température sur sa physiologie et ses comportements. L’accouplement en particulier s’avère crucial pour le maintien des populations de A. listronoti : l’espèce étant haplo-diploïde, une femelle non-accouplée ne donnera naissance qu’à des mâles. L’accouplement d…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Cindy Bouchard
Colloque : 206 - Organismes vivants
La génétique du paysage est un domaine de recherche interdisciplinaire qui s’intéresse à l’effet du paysage et ses changements sur le flux de gènes entre les populations. La connectivité entre les populations permet de maintenir un niveau de diversité génétique favorable à leur évolution La tortue des bois (Glyptemys insculpta) est une espèce en péril sur l’ensemble de son domaine vital. La majorité de ses déplacements terrestres ont lieu à moins de 300 mètres des rivières qu’elle occupe. Aucune des études publiées à ce jour ne met en lien direct le paysage avec la génétique de l’…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Passoret Vounba
Colloque : 206 - Organismes vivants
Les Escherichia coli pathogènes aviaires (APEC) et multirésistants (MDR) sont une préoccupation en industrie avicole. L’objectif de cette étude était de caractériser les E. coli génériques (99), potentiellement pathogènes extraintestinaux (ExPEC) (93) et présumés producteurs de béta-lactamases à spectre étendu (ESBL)/AmpC (113), isolés de poulets de fermes au Québec. La prévalence des MDR était de 61,61%, 63,44% et 100% pour les collections générique, potentiels ExPEC et présumés ESBL/AmpC respectivement. La résistance aux antimicrobiens très importants en santé humaine c…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Barbara Da Rocha
Colloque : 206 - Organismes vivants
Les cellules épithéliales forment un épithélium en créant des interactions cellule-cellule imperméables. Le maintien de ces interactions leur permet de migrer en groupe. Cette migration collective est impliquée dans le développement embryonnaire et l'invasion des carcinomes. Afin de maintenir la cohésion du groupe, les cellules détectent les tensions mécaniques exercées sur leur membrane et s'adaptent à celles-ci. Ces mécanismes d'adaptation impliquent une réorganisation des jonctions entre les cellules et régule l'efficacité de la migration. La base moléculaire de cette adaptation reste p…
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Sabrine Najeh
Colloque : 206 - Organismes vivants
La conception de nouvelles séquences d'ARN qui conservent la fonction de l'ARN original est un défi en bioinformatique en raison de la complexité structurelle de ces molécules. L'ARN peut se replier en une structure secondaire et tertiaire en formant des paires de bases canoniques et non canoniques et idéalement un algorithme devrait prendre en compte ces deux types de paires de bases pour donner un résultat fiable. Dans notre étude, nous utilisons des ribozymes en tête de marteau (HHRz) synthétiques conçus par deux algorithmes différents. Le HHRz est un petit ARN catalytique auto-clivant …
85e Congrès de l'Acfas — Communication orale
Auteur : Vesta Korniakova
Colloque : 206 - Organismes vivants
Les riboswitchs sont des ARN structurés présents majoritairement dans les régions 5′ non traduite d’ARNm qu’ils régulent, chez les bactéries. Ces structures sont composées d’un domaine de liaison de ligand, soit l’aptamère, et d’un domaine à mécanismes-variables contrôlant l’expression d’un gène, soit la plateforme d’expression. L’aptamère d’un riboswitch adopte deux structures différentes : la structure liée et la structure non-liée au ligand. À ce jour, il n’y a qu’une structure non-liée de riboswitch qui a été résolue par crystallographie, contre des dizaines …