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80e Congrès de l’Acfas

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Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée

80e Congrès de l’Acfas

Modélisation moléculaire du PVDF dans les formes amorphes et cristallines

Auteur : Nasim Anousheh
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
La transition vitreuse demeure un sujet d'étude important tant du point de vue théorique qu'expérimental. Dans ce projet, la transition vitreuse du poly(fluorure de vinylidène), PVDF, a été étudiée au niveau de simulations atomistiques de courte durée.En utilisant l'équation de Kohlraush-Williams-Watt (KWW), la Tg du PVDF a été obtenue en bon accord avec les données expérimentales. Nous avons ensuite examiné les effets des défauts structuraux sur la transition vitreuse. Ces défauts sont dus à la présence d'unités monomères inversées, c'est-à-dire par des positionnements «tête à tête»…

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Des protéines à l'état liquide : structure et fonction des protéines élastomères

Auteur : Régis Pomès
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
Les protéines désordonnées abondent et jouent un rôle important dans tous les domaines du vivant. Les états désordonnés des protéines sont difficiles à étudier par les méthodes expérimentales en raison même de leur hétérogénéité structurale et de la tendance de ces protéines à s'agréger. Les simulations par ordinateur, que ces propriétés n'entravent pas, s'avèrent être un outil de choix pour caractériser les ensembles conformationels des protéines intrinsèquement désordonnées. Dans ma présentation, je décrirai l'application des techniques de simulation à l'étude de l'élastine, la protéine …

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Simulation de la spectroscopie des complexes dihalogène-eau : comparaison avec la phase condensée (eau, glace, clathrates)

Auteur : Nadine Halberstadt
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
Le but de ce travail est d'étudier la photoexcitation de molécules chromophores dans deux environnements d'eau importants, les clathrates hydrates et la glace. Notre étude a commencé par des systèmes simples, les hydrates de dihalogènes et la glace dopée par les mêmes molécules, en collaboration avec les groupes d'expérimentateurs de Janda et de Apkarian de l'Université de Californie à Irvine. Nous avons effectué des simulations de spectroscopie d'absorption pour les complexes H2O–X2 (X=Cl, Br) par propagation de paquets d'onde en dimensionalité réduite [1,2]. Les rés…

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Explorer les surfaces de potentiels avec des méthodes d'intelligence artificielle

Auteur : René Fournier
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
Les surfaces de potentiel (SP) des molécules de tailles modérées sont déjà très complexes. La SP d'un agrégat de 13 atomes de métal typique est une fonction de 39 variables qui possède une dizaine de minimas de basse énergie (en principe tous des isomères possibles), des dizaines de chemins de réaction et états de transition connectant ces minimas, et des milliers de minimas locaux à plus haute énergie. Il faut des méthodes très puissantes pour découvrir les éléments clés (minimas, états de transition, chemins de réaction) des SP dans un temps de calcul raisonnable. Nous proposons que le…

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Fusion de nanocristaux de polyéthylène par dynamique moléculaire

Auteur : Samuel Palato
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
Les nanocristaux de polymères attirent de plus en plus l'attention, à la fois par leurs applications technologiques potentielles et par leurs propriétés inédites qui diffèrent des propriétés du polymère massif. Donnant directement accès aux échelles nanométriques, la simulation moléculaire se propose comme un choix naturel permettant l'exploration des propriétés de ces composés. Comme premier modèle, nous avons étudié le polyéthylène (PE) afin de corréler les données émanant de la simulation aux températures de fusion expérimentales du PE nanocristallin. L'utilisation d'alcanes modèl…

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Conception assistée par ordinateur de médicaments

Auteur : Nicolas Moitessier
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
Le développement de médicaments demeure un processus long et laborieux et surtout très couteux. L'emploi de méthodes de simulation informatique permet d'en réduire les couts et d'en accroitre l'efficacité. Le développement d'une plateforme informatique pour la conception de médicaments sera présentée ainsi que son application au développement de molécules a visée thérapeutique. Plus particulièrement, l'application de cette plateforme a la conception d'inhibiteurs de la prolyl oligopeptidase impliquée dans la maladie d'Alzheimer sera présentée. 

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Modélisation et dynamique de complexes et agrégats de molécules aromatiques polycycliques

Auteur : Fernand Spiegelman
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
Les molécules, complexes et agrégats d'hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP)  présentent   un intérêt pour la spectroscopie et la chimie des milieux astrophysiques et également  la chimie  atmosphérique. L'étude théorique au niveau électronique et dynamique de complexes et agrégats moléculaires comprenant 100-1000 atomes demeure un enjeu. Nous examinerons les potentialités des méthodes Tight-Binding dérivées de la théorie de la fonctionnelle de la densité (Density Functional Tight Binding DFTB). Numériquement performantes tout en conservant un caractère quantique électronique, elle…

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Nanocristaux de silicium ultra stables dus à la délocalisation d'électrons

Auteur : Holger Vach
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
En raison du rôle clé que joue l'aromaticité dans le domaine de la chimie organique, un phénomène similaire a été recherché dans les composés de silicium depuis plus d'un siècle. L'approche de l'aromaticité sur la base de liaisons multiples avec les molécules de silicium, comme pour le benzène, a récemment conduit à des progrès considérables. Contrairement au benzène, cependant, ces molécules de silicium doivent être stabilisées par des substituts complexes et encombrants. Ici, nous utilisons une panoplie de méthodes théoriques, telle que les simulations avec des modèles fluides, la dynami…

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Prédiction virtuelle de sites de métabolisme de xénobiotiques par les cytochromes P450s

Auteur : Josh Pottel
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
Le métabolisme des xénobiotiques, en particulier des médicaments, est un processus vital pour contrôler leur temps de demi-vie à l'intérieur du corps humain. Des méthodes expérimentales existent pour identifier les métabolites (médicament transformé résultant de ces processus) et pour en évaluer la stabilité. Cependant, ces méthodes sont longues et couteuses et le développement de systèmes informatiques prédictifs est une voie de recherche prometteuse. Nous présenteront IMPACTS (In-silico Metabolism Prediction by Activated Cytochromes and Transition States), un outil informatique qui combi…

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Mot de bienvenue

Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée

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Étude théorique de la réaction d'alpha-tosyloxylation de cétones à l'aide de réactifs d'iode hypervalent

Auteur : Claude Legault
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
La chimie de l'iode hypervalent est vaste et un intérêt grandissant est porté au développement de methodes énantiosélectives promues par ces réactifs. Dans cette catégorie, la réaction d'alpha-tosyloxylation de cétones utilisant des réactifs d'iode(III) est particulièrement puissante, car elle mène aux alpha-tosyloxy cétones, des synthons chiraux versatiles qui ouvrent la voie, par substitution nucleophile, à de nombreux composés cétones alpha-chiraux. Cette reaction a été premièrement popularisée par Koser et al. en utilisant l'hydroxy(tosyloxy)iodobenzène.(1) Plusieurs questions demeuren…

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Propriétés électroniques de cristaux-p organiques fortement organisés

Auteur : Alain Rochefort
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
La présence d'une forte organisation structurale au sein de systèmes conjugués (molécules, polymères) peut contribuer à induire des variations drastiques de la structure électronique et des propriétés de transports en comparaison des propriétés de la phase désordonnée. Une des plus intrigante et souvent difficile interactions à décrire, même avec des techniques ab-initio de grande qualité comme la DFT, concerne les faibles interactions de type p-p et de van der Waals. Dans cette présentation, je vais présenter quelques conséquences de tels couplage-p au cours d'une croissante augmen…

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Étude théorique du dimère de l'eau en environnement cryogénique

Auteur : Grégoire Guillon
Colloque : 212 - Simulations numériques en chimie et biochimie : des petites molécules isolées aux macromolécules en phase condensée
En raison de sa faible interaction avec une grande variété de dopants, l'environnement de para-hydrogèene, soit sous forme de matrice cryogénique solide ou de goutelettes liquides, constitue un solvant quantique idéal pour l'étude d'un grand nombre d'espèces instables. Notamment, les petits agrégats d'eau, comprenant de deux à une dizaine de molécules, présentent un interêt tout particulier, en raison des propriétés remarquables de cette espèce chimique. Le dimère de l'eau a été particulièrement bien etudié en matrice de gaz rare ou en phase gazeuse, aussi bien sur le plan expérimental que…

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Mesure des particules de biomasse en une, deux et trois dimensions

Auteur : Guillaume Pilon
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
Plusieurs utilisations de matière ligneuse requièrent des particules de longueur et de forme bien définies.  La méthode traditionnelle de caractérisation de la longueur est le tamisage mécanique.  Cependant des études récentes montrent que la densité des biomasses, la préparation des échantillons, la durée du tamisage et le tamiseur influencent les résultats.  Depuis septembre 2010, nous avons accumulé neuf sources de biomasse de saule de forme différente (hachée, broyée ou déchiquetée) et de longueur variée (entre 20 et 100 mm).Les échantillons sont analysés dans trois tamiseurs : c…

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Dépolymérisation par catalyse basique de la lignine en réacteur continu

Auteur : Romain Beauchet
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
La lignine, qui représente de 10 à 30% de la biomasse lignocellulosique représente un potentiel inestimable de valorisation. Celle-ci, considérée comme un sous-produit papetier, est dans la plupart des cas brulée afin de produire de l'énergie et de la chaleur (CHP). Toutefois, sa composition (enchaînement de phenyl propane) est une source potentielle de molécules aromatiques. Une dépolymérisation catalytique de cette macromolécule permet  la production de composés aromatiques hautement valorisables (molécules monoaromatiques : monomères), ainsi que la production d'intermédiaires pour la sy…

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Utilisation de la lignine comme renfort dans les matériaux à base de polyéthylène

Auteur : Lei Hu
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
Les matières plastiques issues de la filière pétrolière jouent un rôle important dans notre société actuellement. Cependant, la ressource pétrolière est épuisable et non-renouvelable. C'est pourquoi le développement des matériaux bio-composites est actuellement en plein essor. Les lignines sont la seconde ressource renouvelable majeure de la biosphère, juste derrière la cellulose. Pourtant, elles sont considérées comme un déchet des industries des pâtes et papiers. En remplaçant des polymères synthétiques par des bio-polymères renouvelables tels que les lignines, ceci contribue à la séques…

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AC3B : nouveau procédé pour la production des biocombustibles et des bioproduits à partir de la biomasse lignocellulosique

Auteur : Raymond Le Van Mao
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits

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Pyrolyse de panic érigé en atmosphère de CO2 et caractérisation de charbon de biomasse

Auteur : Guillaume Pilon
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
Le charbon de biomasse, longtemps perçu comme un résidu, se présente maintenant comme un vecteur de développement durable dans la chaîne de valorisation de la biomasse. Le char de torréfaction (pyrolyse douce) est un combustible potentiel aux propriétés de conservation favorables et le charbon de biomasse pyrolytique a quant à lui le potentiel d'amender les sols et par la même occasion de constituer une méthode de séquestration de carbone. Dans le cadre de cette recherche, une plante lignocellulosique dite « énergétique », le panic érigé, a été pyrolysée dans une atmosphère de CO2

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Évaluation du potentiel des micro-ondes pour le traitement phytosanitaire du bois

Auteur : Ayoub Hanzouli
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
Les échanges des produits commerciaux et leurs matériaux d'emballage à l'échelle intercontinentale sont devenus une piste importante pour l'introduction des espèces envahissantes au Canada et aux États-Unis. Les matériaux d'emballage en bois sont identifiés comme étant une des causes qui a facilité l'introduction des pathogènes et des insectes qui menacent les forêts de l'Est de l'Amérique du Nord. Afin de faire face à cette problématique, un groupe de travail de la Convention Internationale pour la Protection des Végétaux (CIPV) a passé une réglementation qui consiste à effectuer un trait…

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Utilisation des lignines industrielles comme agent de couplage dans les composites contenant de l'écorce

Auteur : Nicolas Mariotti
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
Le projet, a pour objectif de déterminer le potentiel de l'utilisation de lignines industrielles en tant qu'agent de couplage dans un bio-composite de polyéthylène haute densité (HDPE) et de fibres d'écorces. La valorisation de deux coproduits à faible valeur telles que la liqueur noire (source de lignines) et les écorces donne une dimension écoresponsable à ce projet. La réalisation de bio-composites par extrusion puis moulage par compression à chaud permettront de présenter l'impact de la présence d'un agent de couplage commun (5%) et le potentiel d'ajout de la lignine commerciale brute …

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Production de biohydrogène et autres métabolites d'intérêt avec la bactérie Cl. thermocellum en utilisant les boues papetières comme substrat de fermentation

Auteur : Alexandre Moreau
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
Dans la conjoncture actuelle, les papetières canadiennes ont un besoin pressant de diversifier leurs produits. Ces papetières génèrent aussi des tonnes de résidus qu'elles doivent éliminer de façon sécuritaire et économique. Les microorganismes et les enzymes industriels pourraient permettre aux papetières de traiter leurs résidus. Ces mêmes microorganismes et enzymes pourraient également valoriser les résidus pour obtenir des bioproduits qui intégreront des marchés fructueux ou répondront à leurs propres besoins. En effet, une bactérie cellulolytique comme Clostridium thermocellum …

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Utilisation de nanocellulose comme renfort pour les adhésifs

Auteur : Alireza Kaboorani
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
L'acétate de polyvinyle (PVA) est un polymère thermoplastique qui est grandement utilisé dans l'industrie de transformation du bois pour le collage de pièces. Malgré ses avantages, le polymère PVA montre de très faibles performances en ce qui concerne sa plastification en présence d'eau et à des températures élevées. Dans cette recherche, nous étudions la possibilité d'améliorer la résistance du polymère PVA à l'eau et à la chaleur par l'ajout d'un nanomatériau vert, la nanocellulose. Divers mélanges de PVA et de nanocellulose furent préparés. Pour mesurer la résistance mécanique des colla…

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Recyclage des résidus papetiers pour la production de composites bois-plastiques

Auteur : Sebastien Migneault
Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
Les résidus solides récupérés au traitement des eaux usées des usines de pâtes et papierssont appelés boues. La boue est riche en fibres et pourrait donc être utilisée comme composante bois dans les composites bois-plastique (CBP). Ainsi, l'objectif général de l'étude est d'évaluer la faisabilité de produire des CBP avec différentes sources et proportions de boues. Les résidus furent échantillonnés selon 3 procédés papetiers (thermomécanique (TMP), chimico-thermomécanique (CTMP), et Kraft) et caractérisés en termes de composition chimique, de chimie de surface à l'aide de la spectroscopie …

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Conversion des eaux blanches papetières en cellulose bactérienne par G.xylinus

Colloque : 213 - Transformation de la matière ligneuse en bioproduits
Quoique les papetières vivent actuellement des difficultés économiques, elles sont toujours actives et génèrent des volumes importants d'eaux usées à traiter. Le couplage du traitement des eaux usées à l'obtention de produits à valeur ajoutée est une façon de réduire les coûts de traitement et même de diversifier les produits de l'industrie. Parallèlement, la nanocellulose est un produit convoité par les papetières à la recherche de solutions pour leur relance. Elle est normalement obtenue par voie chimique à partir de la biomasse forestière, fraîche ou résiduelle. Elle peut aussi être obt…


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